1月30日，交通运输部印发《关于统筹做好疫情防控与水路运输保障有关工作的紧急通知》（以下简称《通知》）。
《通知》表示，要全力保障湖北特别是武汉地区防疫和生活、重要生产物资水路运输。湖北省交通运输厅要及时掌握运输需求，强化应急船舶运力安排和运输组织。
严禁以疫情防控为名，随意采取禁限货运船舶靠港作业、锚地隔离14天等措施。省级交通运输主管部门要督促辖区内航运企业，按合同要求开展水路货物运输，确保正常有序。
《通知》还要求，航运公司要加强船员自身疫情防护和船员管理，做好船上生活物资供应保障，无特殊情况不得离船上岸，海事管理机构加强现场监管。
此外，各级交通运输主管部门、海事管理机构和港航企业，要建立重点物资水路运输“绿色通道”，优先保障防疫物资和生活物资运输，确保水路运输畅通。如果发现有碍防疫物资、生活物资和重要生产物资水路运输通畅的，应立即纠正。
同时，建立与辖区重点港航企业的点对点联系，加强防疫物资、生活物资和重要生产物资水路运输组织协调保障。对疫情防控和水路运输保障相关工作贯彻落实不力的，交通运输部将予以通报。
此外，1月30日下午，国家卫生健康委员会召开新闻发布会，交通运输部新闻发言人、政策研究室主任吴春耕参加会议，并回答记者提问。
针对春运返程高峰即将到来，交通运输业如何防止疫情扩散的问题，吴春耕介绍说，将具体有五个方面的工作措施：
一是动员全行业力量，继续按照一级响应要求，高标准、高效率开展春运返程阶段交通运输领域疫情防控各项工作，做到守土有责、守土担责、守土尽责。
二是严格落实交通工具通风、消毒和旅客体温检测等要求。在具备条件的服务区和船舶等，设置留验室和隔离区，发现体温异常的第一时间按程序留观、隔离和移交。
三是全力做好交通环节的疫情防控检疫工作。截至1月29日，全国在高速公路服务区、出入口以及客运站、客运码头等交通场站，累计设置1.5万处卫生检疫站。1月29日当天，公路、水路系统一线投入疫情防抗人员56.7万人。
四是指导地方管控进出武汉等地的交通运输工具，暂停进入武汉的道路水路客运班线，以及省际、市际包车客运，严格管控营运车船驶离武汉。全国31个一级响应地区全面暂停省际包车。
五是积极配合做好在交通工具上和病人密切接触人员的追溯工作。对出现的病例和疑似病例，及时将乘客信息提交留验站或最终到达地卫生健康部门；离开交通工具后又发现确诊病例的，及时向卫生健康部门提供同一车厢旅客信息，并通过多种方式寻找密切接触者。